Godt vs. Ondt: Romanen utforsker det klassiske temaet godt mot ondt, representert av Sherlock Holmes and the Hound. Holmes legemliggjør kraften til fornuft og deduksjon, mens hunden symboliserer mørkets og overtroens krefter.
Den menneskelige tilstanden: Romanen fordyper også den menneskelige tilstanden, spesielt temaene frykt, skyld og forløsning. Sir Henry Baskerville er hjemsøkt av familiens forbannelse, mens Dr. Mortimer sliter med skyldfølelse over Sir Charles Baskervilles død. Holmes representerer imidlertid det menneskelige intellektets triumf over overtro og frykt.